Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms