Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms