Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PpifQ99KR7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms