Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms