Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms