Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Reep3Q99KK1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms