Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn2aQ99KJ0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn2aQ99KJ0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms