Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlcd1Q99JT6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlcd1Q99JT6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlcd1Q99JT6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlcd1Q99JT6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlcd1Q99JT6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlcd1Q99JT6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlcd1Q99JT6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlcd1Q99JT6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlcd1Q99JT6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlcd1Q99JT6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlcd1Q99JT6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlcd1Q99JT6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlcd1Q99JT6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlcd1Q99JT6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlcd1Q99JT6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlcd1Q99JT6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlcd1Q99JT6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlcd1Q99JT6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlcd1Q99JT6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlcd1Q99JT6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlcd1Q99JT6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlcd1Q99JT6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlcd1Q99JT6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlcd1Q99JT6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlcd1Q99JT6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlcd1Q99JT6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlcd1Q99JT6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tlcd1Q99JT6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tlcd1Q99JT6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tlcd1Q99JT6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tlcd1Q99JT6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlcd1Q99JT6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms