Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg5Q99J83 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg5Q99J83 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms