Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Def8Q99J78 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Def8Q99J78 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Def8Q99J78 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Def8Q99J78 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Def8Q99J78 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Def8Q99J78 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Def8Q99J78 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Def8Q99J78 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Def8Q99J78 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Def8Q99J78 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Def8Q99J78 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Def8Q99J78 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Def8Q99J78 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Def8Q99J78 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Def8Q99J78 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Def8Q99J78 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Def8Q99J78 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Def8Q99J78 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Def8Q99J78 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Def8Q99J78 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Def8Q99J78 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Def8Q99J78 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Def8Q99J78 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Def8Q99J78 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Def8Q99J78 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Def8Q99J78 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Def8Q99J78 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Def8Q99J78 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms