Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms