Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Cldn16Q925N4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Cldn16Q925N4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Cldn16Q925N4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Cldn16Q925N4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn16Q925N4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn16Q925N4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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