Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PdgfdQ925I7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms