Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms