Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csmd1Q923L3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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