Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med28Q920D3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms