Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpe65Q91ZQ5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpe65Q91ZQ5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpe65Q91ZQ5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms