Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chrna2Q91X60 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chrna2Q91X60 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chrna2Q91X60 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chrna2Q91X60 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chrna2Q91X60 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chrna2Q91X60 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chrna2Q91X60 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chrna2Q91X60 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chrna2Q91X60 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chrna2Q91X60 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chrna2Q91X60 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chrna2Q91X60 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chrna2Q91X60 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chrna2Q91X60 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Chrna2Q91X60 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chrna2Q91X60 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chrna2Q91X60 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chrna2Q91X60 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chrna2Q91X60 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chrna2Q91X60 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms