Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE4

UPF0729 protein C18orf32 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q91WE4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q91WE4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q91WE4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q91WE4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q91WE4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q91WE4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q91WE4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q91WE4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q91WE4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q91WE4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q91WE4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q91WE4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q91WE4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q91WE4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q91WE4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q91WE4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q91WE4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q91WE4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q91WE4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q91WE4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q91WE4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q91WE4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q91WE4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q91WE4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q91WE4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q91WE4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q91WE4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q91WE4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q91WE4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q91WE4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q91WE4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q91WE4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q91WE4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q91WE4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q91WE4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q91WE4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q91WE4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q91WE4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q91WE4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q91WE4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q91WE4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q91WE4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q91WE4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q91WE4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q91WE4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q91WE4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q91WE4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q91WE4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q91WE4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q91WE4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q91WE4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q91WE4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q91WE4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q91WE4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q91WE4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q91WE4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q91WE4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q91WE4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Q91WE4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q91WE4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Q91WE4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q91WE4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q91WE4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q91WE4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q91WE4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q91WE4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q91WE4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q91WE4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q91WE4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q91WE4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q91WE4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q91WE4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q91WE4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q91WE4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q91WE4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q91WE4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q91WE4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q91WE4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q91WE4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q91WE4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q91WE4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q91WE4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q91WE4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q91WE4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q91WE4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q91WE4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q91WE4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q91WE4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q91WE4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q91WE4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q91WE4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q91WE4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q91WE4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q91WE4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q91WE4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q91WE4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q91WE4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q91WE4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q91WE4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q91WE4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms