Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tdrd3Q91W18 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms