Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacng8Q8VHW2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacng8Q8VHW2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacng8Q8VHW2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacng8Q8VHW2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacng8Q8VHW2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacng8Q8VHW2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacng8Q8VHW2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacng8Q8VHW2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacng8Q8VHW2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacng8Q8VHW2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng8Q8VHW2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng8Q8VHW2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng8Q8VHW2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng8Q8VHW2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng8Q8VHW2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng8Q8VHW2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng8Q8VHW2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng8Q8VHW2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng8Q8VHW2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng8Q8VHW2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacng8Q8VHW2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacng8Q8VHW2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacng8Q8VHW2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacng8Q8VHW2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacng8Q8VHW2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms