Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vps4aQ8VEJ9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vps4aQ8VEJ9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.9 ms