Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE47

Uba5, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 5, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba5Q8VE47 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uba5Q8VE47 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uba5Q8VE47 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uba5Q8VE47 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uba5Q8VE47 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uba5Q8VE47 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Uba5Q8VE47 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uba5Q8VE47 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uba5Q8VE47 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uba5Q8VE47 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uba5Q8VE47 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uba5Q8VE47 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uba5Q8VE47 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uba5Q8VE47 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms