Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VCE4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VCE4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VCE4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8VCE4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VCE4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms