Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc9Q8VC31 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms