Protein–RNA interactions for Protein: Q8R570

Snap47, Synaptosomal-associated protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap47Q8R570 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snap47Q8R570 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snap47Q8R570 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snap47Q8R570 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snap47Q8R570 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snap47Q8R570 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snap47Q8R570 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snap47Q8R570 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snap47Q8R570 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snap47Q8R570 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snap47Q8R570 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snap47Q8R570 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snap47Q8R570 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Snap47Q8R570 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snap47Q8R570 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snap47Q8R570 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms