Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F3

Sumf1, Sulfatase-modifying factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumf1Q8R0F3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sumf1Q8R0F3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms