Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sf3b4Q8QZY9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b4Q8QZY9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b4Q8QZY9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.2 ms