Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf183Q8QZS5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf183Q8QZS5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf183Q8QZS5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf183Q8QZS5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf183Q8QZS5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf183Q8QZS5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf183Q8QZS5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf183Q8QZS5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf183Q8QZS5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf183Q8QZS5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf183Q8QZS5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf183Q8QZS5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf183Q8QZS5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf183Q8QZS5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf183Q8QZS5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf183Q8QZS5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms