Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc5Q8K4Z2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc5Q8K4Z2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms