Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L4

Pof1b, Protein POF1B, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pof1bQ8K4L4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pof1bQ8K4L4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pof1bQ8K4L4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pof1bQ8K4L4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pof1bQ8K4L4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pof1bQ8K4L4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pof1bQ8K4L4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pof1bQ8K4L4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pof1bQ8K4L4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pof1bQ8K4L4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pof1bQ8K4L4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pof1bQ8K4L4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pof1bQ8K4L4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pof1bQ8K4L4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pof1bQ8K4L4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pof1bQ8K4L4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pof1bQ8K4L4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pof1bQ8K4L4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pof1bQ8K4L4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pof1bQ8K4L4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pof1bQ8K4L4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pof1bQ8K4L4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pof1bQ8K4L4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pof1bQ8K4L4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pof1bQ8K4L4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pof1bQ8K4L4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pof1bQ8K4L4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pof1bQ8K4L4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pof1bQ8K4L4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pof1bQ8K4L4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pof1bQ8K4L4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pof1bQ8K4L4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pof1bQ8K4L4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pof1bQ8K4L4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms