Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Depp1Q8K2F3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms