Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mtmr3Q8K296 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mtmr3Q8K296 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mtmr3Q8K296 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mtmr3Q8K296 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mtmr3Q8K296 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mtmr3Q8K296 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtmr3Q8K296 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms