Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neil3Q8K203 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms