Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms