Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek9Q8K1R7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms