Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms