Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Afg3l2Q8JZQ2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Afg3l2Q8JZQ2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Afg3l2Q8JZQ2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Afg3l2Q8JZQ2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Afg3l2Q8JZQ2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Afg3l2Q8JZQ2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Afg3l2Q8JZQ2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Afg3l2Q8JZQ2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Afg3l2Q8JZQ2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Afg3l2Q8JZQ2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Afg3l2Q8JZQ2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Afg3l2Q8JZQ2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Afg3l2Q8JZQ2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Afg3l2Q8JZQ2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Afg3l2Q8JZQ2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Afg3l2Q8JZQ2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Afg3l2Q8JZQ2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Afg3l2Q8JZQ2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Afg3l2Q8JZQ2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Afg3l2Q8JZQ2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Afg3l2Q8JZQ2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Afg3l2Q8JZQ2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Afg3l2Q8JZQ2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Afg3l2Q8JZQ2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Afg3l2Q8JZQ2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Afg3l2Q8JZQ2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms