Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SbsnQ8CIT9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms