Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Syne4Q8CII8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms