Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFW7

Cc2d2a, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2aQ8CFW7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cc2d2aQ8CFW7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cc2d2aQ8CFW7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cc2d2aQ8CFW7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cc2d2aQ8CFW7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cc2d2aQ8CFW7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cc2d2aQ8CFW7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cc2d2aQ8CFW7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cc2d2aQ8CFW7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cc2d2aQ8CFW7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cc2d2aQ8CFW7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cc2d2aQ8CFW7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Cc2d2aQ8CFW7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cc2d2aQ8CFW7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cc2d2aQ8CFW7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cc2d2aQ8CFW7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cc2d2aQ8CFW7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cc2d2aQ8CFW7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cc2d2aQ8CFW7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cc2d2aQ8CFW7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Cc2d2aQ8CFW7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cc2d2aQ8CFW7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Cc2d2aQ8CFW7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Cc2d2aQ8CFW7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms