Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFF0

Parp11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp11Q8CFF0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms