Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Ercc8Q8CFD5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Ercc8Q8CFD5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ercc8Q8CFD5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ercc8Q8CFD5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc8Q8CFD5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc8Q8CFD5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms