Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Lrrc9Q8CDN9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Lrrc9Q8CDN9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lrrc9Q8CDN9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lrrc9Q8CDN9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lrrc9Q8CDN9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Lrrc9Q8CDN9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lrrc9Q8CDN9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lrrc9Q8CDN9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lrrc9Q8CDN9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lrrc9Q8CDN9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lrrc9Q8CDN9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lrrc9Q8CDN9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lrrc9Q8CDN9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lrrc9Q8CDN9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lrrc9Q8CDN9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lrrc9Q8CDN9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lrrc9Q8CDN9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lrrc9Q8CDN9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lrrc9Q8CDN9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lrrc9Q8CDN9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lrrc9Q8CDN9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lrrc9Q8CDN9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lrrc9Q8CDN9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lrrc9Q8CDN9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lrrc9Q8CDN9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lrrc9Q8CDN9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
Lrrc9Q8CDN9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms