Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ufl1Q8CCJ3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ufl1Q8CCJ3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms