Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb2Q8CC27 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacnb2Q8CC27 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms