Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB67

Lrp11, Low-density lipoprotein receptor-related protein 11, mousemouse

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp11Q8CB67 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrp11Q8CB67 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrp11Q8CB67 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrp11Q8CB67 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrp11Q8CB67 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrp11Q8CB67 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrp11Q8CB67 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrp11Q8CB67 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrp11Q8CB67 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrp11Q8CB67 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrp11Q8CB67 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrp11Q8CB67 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrp11Q8CB67 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrp11Q8CB67 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp11Q8CB67 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrp11Q8CB67 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrp11Q8CB67 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrp11Q8CB67 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrp11Q8CB67 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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