Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg4aQ8C9S8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg4aQ8C9S8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg4aQ8C9S8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg4aQ8C9S8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg4aQ8C9S8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg4aQ8C9S8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg4aQ8C9S8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg4aQ8C9S8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg4aQ8C9S8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg4aQ8C9S8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg4aQ8C9S8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg4aQ8C9S8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg4aQ8C9S8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg4aQ8C9S8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg4aQ8C9S8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg4aQ8C9S8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg4aQ8C9S8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg4aQ8C9S8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg4aQ8C9S8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg4aQ8C9S8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg4aQ8C9S8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg4aQ8C9S8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg4aQ8C9S8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg4aQ8C9S8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg4aQ8C9S8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg4aQ8C9S8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg4aQ8C9S8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg4aQ8C9S8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
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