Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4933409G03RikQ8C5U0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933409G03RikQ8C5U0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.32■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.31■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.3■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.29■■□□□ 1
4933409G03RikQ8C5U0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms