Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc90bQ8C3X2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms